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/ Software Vault: The Diamond Collection / The Diamond Collection (Software Vault)(Digital Impact).ISO / cdr16 / med9505a.zip / M9550061.TXT < prev    next >
Text File  |  1995-03-04  |  3KB  |  42 lines
  1.        Document 0061
  2.  DOCN  M9550061
  3.  TI    In vivo decay kinetic parameters of hammerhead ribozymes.
  4.  DT    9505
  5.  AU    Sioud M; Opstad A; Zhao JQ; Levitz R; Benham C; Drlica K; Institute of
  6.        Immunology and Rheumatology, Rikshospitalet, Oslo,; Norway.
  7.  SO    Nucleic Acids Res. 1994 Dec 25;22(25):5571-5. Unique Identifier :
  8.        AIDSLINE MED/95140617
  9.  AB    Ribozymes offer a potentially important way to inactivate intracellular
  10.        RNA from almost any gene whose nucleotide sequence is known. Recently,
  11.        we found that hammerhead ribozymes directed against mRNA of tumour
  12.        necrosis factor alpha (TNF alpha) and its derivatives, preferentially
  13.        bind to a cellular protein(s). To better understand the effect of
  14.        different 3'-terminal hairpins on ribozyme stability as well as their
  15.        effect on the protein binding to the ribozyme, a mathematical treatment
  16.        of the decay of three TNF alpha ribozymes that differed at their 3' ends
  17.        was performed. One ribozyme contained a 3'-terminal hairpin derived from
  18.        a transcription terminator of bacteriophage T7, another contained the
  19.        same hairpin but modified to be highly enriched for G+C nucleotides, and
  20.        a third lacked a hairpin. The TNF alpha ribozyme decay had two kinetic
  21.        components. The slow component exhibited exponential decay with a half
  22.        life of approximately 250 h in all cases. The 3'-terminal hairpin has no
  23.        significant effect on this component. This slow phase accounted for
  24.        60-80% of ribozyme decay. The rapid phase also exhibited exponential
  25.        decay. For this phase, a 3'-terminal hairpin roughly doubled the
  26.        half-life (1.7-3.4). The slow phase of degradation was about three times
  27.        faster for a ribozyme directed at the integrase mRNA of human
  28.        immunodeficiency virus-1 than that seen with the TNF alpha ribozyme.
  29.        Taken together, these results suggest that the ribozyme population is
  30.        initially sensitive to degradation, with the presence of a hairpin
  31.        provides some protection, and indicate that the addition of the hairpin
  32.        to the ribozyme did not prevent the in vivo additional stabilizing
  33.        effect of the protein(s).
  34.  DE    Base Sequence  Cell Line  Human  Kinetics  Molecular Sequence Data
  35.        Nucleic Acid Denaturation  RNA, Catalytic/*CHEMISTRY  Support, Non-U.S.
  36.        Gov't  Support, U.S. Gov't, P.H.S.  Transfection  Tumor Necrosis
  37.        Factor/*GENETICS  JOURNAL ARTICLE
  38.  
  39.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  40.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  41.  
  42.